Відсутні гени більш вірогідні у хворих на аутизм
Це означає, що ці особи - 7 відсотків досліджуваної групи - мали одну копію одного або декількох генів, коли вони мали б мати два, зазначають дослідники з медичної школи Ікана на горі Сінай у Нью-Йорку.
"Це перша висновок про те, що малі делеції, що впливають на один або два гени, виявляються загальними явищами аутизму, і що ці делеції сприяють ризику розвитку розладу", - сказав провідний дослідник дослідження Джозеф Д. Буксбаум, доктор філософії. , професор кафедри психіатрії, генетики та геномних наук та неврології.
"Цей висновок потрібно розширити в інших незалежних зразках ASD, щоб ми могли по-справжньому зрозуміти, як проявляється ризик".
За словами Буксбаума, цей процес зараз триває. Консорціум із секвенування аутизму, який складається з більш ніж 25 установ, отримав грант від Національного інституту охорони здоров’я на 7 мільйонів доларів для продовження аналізу геномів тисяч осіб, які страждають на АСД на горі Синай.
Аутизм, який вражає близько 1 відсотка населення, є порушенням розвитку, яке, як вважають, спричинене складною взаємодією між генетичними та екологічними факторами. Хоча розлад може передаватися у спадок, за словами Буксбаума, більшість випадків аутизму не можна віднести до відомих успадкованих причин.
Хоча дослідження показали, що може існувати до 1000 генів або геномних областей, які сприяють аутизму, більшість досліджень шукали або одноточкові мутації - зміну однієї літери ДНК на гені - або великі ділянки геному , що охоплює багато генів, що змінюється.
Для свого дослідження вчені просканували геном сотень особин за допомогою технології секвенування генів. Вони шукали варіацію кількості дрібних копій - видалення чи дублювання генів - між особами з аутизмом та контрольною групою людей без розладу.
Для проведення дослідження вони використали секвенування екзомів, щоб переглянути всі 22000 генів людини в наборі зразків. Потім вони проаналізували ці дані за допомогою програми eXome Hidden Markov Model (XHMM). Разом із цим інструменти - це перші, хто може знайти в геномі окремі делеції чи доповнення розміром гена, на думку дослідників.
"Це дає нам можливість вперше провести один тест із зразка крові та порівняти його з еталонним геномом для пошуку мутацій та варіації кількості малих копій у пацієнтів", - пояснив Буксбаум.
Дослідники проаналізували базу даних, що складалася з 431 випадку аутизму та 379 відповідних контролів, загалом 811 осіб. Вони виявили 803 делеції генів у групі аутистів та 583 делеції генів у контрольній групі. Вони також виявили, що у хворих на аутизм більша ймовірність кількох невеликих видалень.
"Зараз відомо, що недосконале число копій генів є одним з основних джерел мінливості між людьми", - сказав Буксбаум.
“Одна з причин, по якій ми відрізняємось один від одного, полягає в додаванні чи делеції генів, які часто передаються у спадок. Але з додаткових делецій, які ми спостерігаємо при ASD, не всі пов’язані з генетичним успадкуванням. Деякі трапляються під час розвитку яйцеклітини або сперми, і делеції, які розвиваються таким чином, як правило, пов’язані з розладом ”.
Дослідники виявили, що значна частина делецій генів у тих, хто страждає на аутизм, була пов’язана з аутофагією - процесом, який підтримує клітини здоровими, замінюючи мембрани та органели.
"Існує вагома причина вважати, що аутофагія дійсно важлива для розвитку мозку, оскільки мозок виробляє набагато більше синапсів, ніж йому потрібно, а надлишок потрібно зменшити", - сказав Буксбаум. “Занадто багато або занадто мало синапсів мають однаковий ефект, оскільки комунікація не працює дуже добре. Це може означати, що деякі синаптичні зв’язки з’являються занадто пізно і можуть не затвердіти належним чином ”.
Дослідники заявляють, що вірять висновкам, опублікованим у Американський журнал генетики людини, матиме клінічне значення.
"Варіації кількості ключових копій - ті, які постійно з'являються в аутичній популяції - можуть вплинути на генетичне тестування", - підсумував Буксбаум.
Джерело: Лікарня Гора Синай / Медична школа Гори Сінай
