Нове дослідження шизофренії зосереджується на білково-білкових взаємодіях

Подібно до людей, багато чого можна дізнатись про ген, подивившись на компанію, яку він утримує, і спостерігаючи за його поведінкою. Намагаючись розкрити більше підказок про розвиток шизофренії, дослідники Університету Пітсбурзької школи медицини дослідили, як білки, що виробляються генами, пов'язаними з шизофренією, взаємодіють між собою.

"Ми можемо зробити висновок про те, що може зробити білок, перевіривши компанію, яку він утримує", - сказала старший дослідник Мадхаві Ганапатірадзю, доктор філософії, доцент кафедри біомедичної інформатики Медичної школи Пітта.

«Наприклад, якщо я знаю, що у вас є багато друзів, які грають у хокей, це може означати, що ви теж займаєтеся хокеєм. Подібним чином, якщо ми бачимо, що, наприклад, невідомий білок взаємодіє з кількома білками, що беруть участь у нервовій передачі сигналів, існує велика ймовірність того, що невідомий суб’єкт також бере участь у тому самому ”.

За недавню історію вчені провели багато досліджень асоціацій по всьому геному (GWAS), які успішно виявили варіанти генів, пов’язані з підвищеним ризиком розвитку шизофренії. Однак порівняно мало відомо про білки, які виробляють ці гени, що вони роблять і як вони взаємодіють, стверджують дослідники.

"Дослідження GWAS та інші дослідницькі зусилля показали нам, які гени можуть бути актуальними при шизофренії", - сказав Ганапатіраю. «Те, що ми зробили, - це наступний крок. Ми намагаємося зрозуміти, як ці гени співвідносяться між собою, що може показати нам біологічні шляхи, які важливі для хвороби ".

У двох словах, кожен ген виробляє білки, і ці білки, як правило, взаємодіють між собою в біологічному процесі. Вивчення того, як ці білки поводяться між собою, може пролити світло на роль ще не вивченого гена, виявивши шляхи та біологічні процеси, пов'язані з шизофренією, а також його зв'язок з іншими складними захворюваннями.

Після розробки та використання нової обчислювальної моделі, яка отримала назву Високоточне передбачення взаємодії білків (HiPPIP), дослідники виявили понад 500 нових білково-білкових взаємодій (ІПП), пов’язаних з генами, пов’язаними з шизофренією.

Дослідники додають, що в той час як гени, пов'язані з шизофренією, ідентифіковані історично та за допомогою GWAS мало перекривались, модель показала, що вони мають більше 100 спільних взаємодіючих речовин. Отримані дані могли б призвести до глибшого розуміння біологічних основ цієї психічної хвороби, а також вказати шлях до лікування.

Висновки опубліковані в Інтернеті в npj шизофренія, журнал Nature Publishing Group.

Джерело: Університети Пітсбурга, Школи медичних наук