Дослідження знаходить геномні сайти, прив’язані до депресії

Нове геномне дослідження вперше виявило 15 областей геному, які, схоже, пов’язані з депресією у осіб європейського походження.

У дослідженні слідчі застосували новий метод зарахування учасників. Замість того, щоб набирати учасників, а потім секвенувати гени, дослідники аналізували дані, якими вже ділилися люди, які придбали власні генетичні профілі через Інтернет-сервіс і вирішили взяти участь у його варіанті дослідження.

Це дозволило використовувати статистичну потужність величезного обсягу вибірки для виявлення слабких генетичних сигналів, пов'язаних з діагнозом, який, ймовірно, простежується до множинних основних процесів захворювання. Це творче використання даних, отриманих за допомогою натовпу, було підтверджено результатами традиційних генетичних підходів у дослідженні.

Результати дослідження публікуються в попередній інтернет-публікації вГенетика природи.

"Визначення генів, які впливають на ризик захворювання, є першим кроком до розуміння самої біології хвороби, що дає нам цілі, спрямовані на розробку нових методів лікування", - говорить Рой Перліс, доктор медичних наук, лікарня Массачусетської загальної лікарні -кореспондент-автор доповіді.

"Більш загально, пошук генів, пов'язаних з депресією, повинен допомогти зрозуміти, що це хвороба мозку, яка, як ми сподіваємось, зменшить стигму, як і раніше пов'язану з подібними видами хвороб".

Хоча загальновідомо, що депресія може протікати в сім'ях, більшість попередніх генетичних досліджень не змогли визначити варіанти, що впливають на ризик депресії.

В одному дослідженні було виявлено два геномні регіони, які можуть сприяти ризику захворювань у китайських жінок, але ці варіанти надзвичайно рідкісні для інших етнічних груп.

Перліс та його колеги зазначають, що безліч різних форм, в яких депресія проявляється і вражає пацієнтів, означає, що, як і на інші психічні розлади, на неї, ймовірно, впливає багато генів з ефектами, які можуть бути занадто тонкими, щоб їх можна було виявити в попередніх порівняно невеликих дослідженнях.

На відміну від традиційних методів набору учасників дослідження - які передбачають пошук і зарахування потенційних учасників, а потім проведення всебічних співбесід, перш ніж фактично генотипувати кожного індивіда - у цьому дослідженні використовувались дані, зібрані від клієнтів 23andMe, компанії з генетичного тестування безпосередньо споживачам, яка погодилася взяти участь у дослідженнях.

Участь включає відповідь на опитування та заповнення інформації про історію хвороби, а також фізичну та демографічну інформацію. Платформа дослідників 23andMe використовує зведені дані, що не ідентифікують.

Для поточного дослідження дослідники вперше проаналізували загальні генетичні варіації, використовуючи дані понад 300 000 особин європейського походження з бази даних 23andMe, понад 75 000 з яких повідомили, що їм був поставлений діагноз або лікували депресію, і понад 230 000 без історії захворювання депресія.

Цей аналіз виявив дві геномні області - одна, що містить погано зрозумілий ген, який, як відомо, експресується в мозку, а інша, що містить ген, раніше асоційований з епілепсією та інтелектуальною недостатністю, - як суттєво пов'язана з ризиком депресії.

Дослідницька група поєднала цю інформацію з даними групи менших досліджень асоціацій геному, в яких було залучено близько 9200 осіб з історією депресії та 9500 контрольних груп, а потім більш ретельно проаналізовані місця можливих генів ризику у зразках іншої групи клієнтів 23andMe - майже 45 800 з депресією та 106 000 контролів.

Результати виявили 15 геномних областей, включаючи 17 конкретних місць, як суттєво пов'язаних з діагнозом депресії. Деякі з цих місць знаходяться в генах або поблизу них, про які відомо, що вони беруть участь у розвитку мозку.

«Моделям, заснованим на нейромедіаторах, які ми зараз використовуємо для лікування депресії, більше 40 років, і нам дійсно потрібні нові цілі лікування. Ми сподіваємось, що пошук цих генів спрямує нас на нові стратегії лікування ”, - сказав Перліс, доцент кафедри психіатрії в Гарвардській медичній школі.

«Ще одним ключовим висновком нашого дослідження є те, що традиційний спосіб проведення генетичних досліджень - не єдиний, який працює. Використання існуючих великих наборів даних або біобанків може бути набагато ефективнішим і може бути корисним для інших психічних розладів, таких як тривожні розлади, де традиційні підходи також не мали успіху ".

Джерело: Масачусетська загальна лікарня